北京时间11月23日凌晨,年合成生物学领域国际顶尖赛事——国际基因工程机器大赛(InternationalGeneticallyEngineeredMachineCompetition,以下简称为iGEM)落下帷幕。疫情期间,此项赛事转为线上进行。电子科大参赛的软件队(UESTC-Software)从全球33个国家的支队伍中脱颖而出,凭借“CPD3DS”(ClassificationofProteinDomainsin3DShapetodesignastandardsetofproteinbricks)项目,获得金牌。此外,软件队还获得了所在组别的BEST提名奖(BestSoftwareProject)。

至此,我校代表队已经创造了连续八年夺金、四次最佳单项奖、七次最佳单项奖提名的成绩。队员们用行动向世界展现了成电人自强不息、拼搏向上的奋斗精神。

新冠疫情也没有阻挡前进的步伐,一起来了解一下金牌项目吧!

今年5月,在教务处的大力支持下,来自生命学院、软件学院、光电学院的11名本科生加入iGEM校集训队,在没有暑假、没有周末的半年时间里于家中进行线上集训,在教练的带领下如火如荼地备赛。

作为软件组的队伍,UESTC-Software专注于构建数据库对3D形状的蛋白质结构域进行分类,并设计了一套标准的蛋白质砖。蛋白质负责细胞中大部分的生理功能,许多合成生物学家专注于根据需要设计定制的蛋白质。如今,蛋白质设计大多是从新的氨基酸序列开始的,工作量无疑是巨大的。同时,蛋白质的结构往往与蛋白质的功能密切相关。UESTC-Software的项目CPD3DS直接使用结构域作为分析蛋白质结构的基本单元。为了得到一组蛋白质砖,根据结构特征对结构域进行分类,并使用3D-Zernike描述符对现有数据库中的所有结构域进行聚类。团队开发了一个用户友好的网站,称为CPD3DS,用于检索、分析和可视化分类蛋白结构域。此外,队员们还设计了一套蛋白质砖积木——Probrick用于教学和推广合成生物学。

功夫不负有心人,在总决赛答辩时,队员们将项目设计和结果娓娓道来,回答了裁判们的所有提问,得到了裁判对项目构思、产品功能、wiki、poster等方面的赞赏与鼓励。在展示和交流中,两支队伍与世界各地的竞赛队伍充分交换想法,启发思维,在科研项目设计方面取得了长足进步。

科学与趣味兼备,让合成生物学走进更多人的生活

在过去的半年里,除了全身心地投入项目,软件队和实验队还一同走进四川科技馆,为来自近个家庭的小朋友们带去了“周末大侦探——开启合成生物学之旅”活动,带领小小侦探们一起来探察神奇的微观世界,了解细胞结构的秘密,观看纸张脱墨的过程,运用积木拼接蛋白质,让iGEM与合成生物学走进公众的视野。

小朋友们动手画出眼中的微观世界

纸精灵奇幻夜舞台剧现场

值得一提的是,为了让孩子们更好地观察蛋白质的结构,软件队还举办了Probrick蛋白质艺术展览。展览当天在走廊两侧展示了8组由积木拼成的蛋白质,每一块积木都是3D打印而成的。队员向小朋友们介绍蛋白质的功能和形状,一边回答孩子们关于蛋白质结构域的问题。

家庭参观Probrick积木艺术展览

Probrick积木艺术展览

此次精彩的活动吸引了大量媒体朋友,四川卫视、今日头条、四川观察网、川观新闻等媒体随iGEM队员全程参与活动,分享科普知识。

合成生物学的普及,



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